Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
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