Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NBR1Q14596 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms