Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
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