Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL4AQ13619 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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