Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
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