Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 CCNI-206ENST00000511943 576 ntTSL 35.43□□□□□ -1.541e-24■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.61e-7■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.931e-7■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 DRAP1-204ENST00000525501 695 ntTSL 533.19■■■□□ 2.94e-15■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.776e-7■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.441e-6■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.271e-6■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.236e-7■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 EIF3L-213ENST00000482600 1294 ntTSL 511.33□□□□□ -0.61e-10■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 EIF3L-207ENST00000450376 520 ntTSL 58.86□□□□□ -0.991e-10■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.78□□□□□ -1.481e-10■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 NT5DC2-207ENST00000469616 453 ntTSL 27.96□□□□□ -1.143e-9■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 GSTO1-204ENST00000445155 829 ntTSL 226.57■■□□□ 1.841e-11■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 SLC25A3-210ENST00000548480 722 ntTSL 23.97□□□□□ -1.779e-28■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.51e-8■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.491e-8■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 COX7A2-203ENST00000377978 366 ntTSL 57.43□□□□□ -1.221e-8■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 SLC25A3-207ENST00000547869 1018 ntTSL 28.09□□□□□ -1.111e-27■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 COASY-213ENST00000591753 2225 ntTSL 1 (best)18.55■□□□□ 0.561e-6■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 COASY-212ENST00000591583 716 ntTSL 215.76■□□□□ 0.111e-6■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.081e-6■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 COASY-201ENST00000393818 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.131e-6■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 H3F3B-209ENST00000589949 842 ntTSL 221.9■■□□□ 1.12e-45■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.412e-7■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.112e-7■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 CRTC2-201ENST00000303569 2290 ntTSL 524.49■■□□□ 1.516e-7■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.416e-7■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.616e-7■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.593e-13■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 MRPS12-204ENST00000598734 641 ntTSL 316.16■□□□□ 0.182e-7■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 CRTC2-207ENST00000487235 2263 ntTSL 215.97■□□□□ 0.156e-7■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 CRTC2-204ENST00000461638 2343 ntTSL 1 (best)13.01□□□□□ -0.336e-7■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 SNRNP200-208ENST00000497539 2666 ntTSL 1 (best)12.66□□□□□ -0.381e-6■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 SNRNP200-201ENST00000323853 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.51e-6■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.19e-12■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.229e-12■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 UQCRB-205ENST00000518876 3968 ntTSL 1 (best)7.18□□□□□ -1.269e-12■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 UQCRB-207ENST00000521036 982 ntTSL 27.08□□□□□ -1.289e-12■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 UQCRB-203ENST00000517603 1041 ntTSL 1 (best)6.71□□□□□ -1.349e-12■■■□□ 15.3
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PABPC4Q13310 EZR-201ENST00000337147 3068 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.24e-9■■■□□ 15.3
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PABPC4Q13310 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.213e-13■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 SEC16A-208ENST00000467838 1988 ntTSL 215.76■□□□□ 0.113e-13■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 SEC16A-207ENST00000453963 4834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)13.04□□□□□ -0.323e-13■■■□□ 15.3
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PABPC4Q13310 SEC16A-204ENST00000313084 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.633e-13■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 SEC16A-203ENST00000313050 8806 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.673e-13■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 SEC16A-201ENST00000277537 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)10.05□□□□□ -0.83e-13■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.147e-7■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.882e-8■■■□□ 15.3
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PABPC4Q13310 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.262e-8■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.222e-8■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.23e-13■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.273e-13■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 ZC3H11A-213ENST00000638800 7078 ntTSL 56.17□□□□□ -1.423e-13■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.483e-13■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.493e-13■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 ZC3H11A-212ENST00000495527 8404 ntTSL 1 (best)5.36□□□□□ -1.553e-13■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.623e-13■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 ZC3H11A-215ENST00000640465 4365 ntTSL 1 (best)4.4□□□□□ -1.73e-13■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.012e-6■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 NAA10-206ENST00000432089 599 ntTSL 323.53■■□□□ 1.362e-8■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 NDUFV1-210ENST00000527923 594 ntTSL 223.92■■□□□ 1.422e-13■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 MAP2K2-208ENST00000599345 923 ntTSL 524.36■■□□□ 1.496e-6■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 GAS5-216ENST00000443799 897 ntTSL 511.46□□□□□ -0.573e-27■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.421e-9■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 SRSF2-206ENST00000582449 1518 ntTSL 223.07■■□□□ 1.284e-13■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 14e-13■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 SRSF2-208ENST00000585202 1359 ntTSL 317.27■□□□□ 0.354e-13■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.124e-13■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 SRSF2-209ENST00000586778 1001 ntTSL 24.84□□□□□ -1.634e-13■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.55e-15■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.415e-15■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 TAF10-205ENST00000616342 5392 ntTSL 1 (best)14.91□□□□□ -0.021e-6■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.932e-7■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 TXN-203ENST00000487892 540 ntTSL 27.53□□□□□ -1.22e-7■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 AC245033.1-201ENST00000562833 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.54e-8■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.765e-7■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 PPM1G-202ENST00000472077 3752 ntTSL 210.23□□□□□ -0.775e-7■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 COX7C-201ENST00000247655 666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.536e-8■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 COX7C-207ENST00000515763 347 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.536e-8■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 COX7C-203ENST00000509578 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.96e-8■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 COX7C-202ENST00000505430 496 ntTSL 35.27□□□□□ -1.576e-8■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 COX7C-205ENST00000511472 369 ntTSL 25.22□□□□□ -1.576e-8■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.299e-8■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 COPG1-210ENST00000515725 3231 ntTSL 210.22□□□□□ -0.773e-7■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 COPG1-201ENST00000314797 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.913e-7■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 MED15-222ENST00000473244 2733 ntTSL 1 (best)21.24■□□□□ 0.997e-11■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 MED15-231ENST00000493216 4701 ntTSL 218.9■□□□□ 0.627e-11■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.327e-11■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.147e-11■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 MED15-211ENST00000433831 3267 ntTSL 515.65■□□□□ 0.17e-11■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 MED15-201ENST00000263205 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.087e-11■■■□□ 15.3
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