Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
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