Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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