Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms