Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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