Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
STX4Q12846 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
STX4Q12846 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
STX4Q12846 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
STX4Q12846 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
STX4Q12846 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
STX4Q12846 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
STX4Q12846 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
STX4Q12846 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
STX4Q12846 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
STX4Q12846 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
STX4Q12846 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
STX4Q12846 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
STX4Q12846 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
STX4Q12846 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
STX4Q12846 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
STX4Q12846 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
STX4Q12846 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
STX4Q12846 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
STX4Q12846 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
STX4Q12846 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
STX4Q12846 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
STX4Q12846 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
STX4Q12846 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
STX4Q12846 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
STX4Q12846 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
STX4Q12846 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
STX4Q12846 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
STX4Q12846 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
STX4Q12846 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
STX4Q12846 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
STX4Q12846 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
STX4Q12846 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
STX4Q12846 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
STX4Q12846 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
STX4Q12846 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
STX4Q12846 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
STX4Q12846 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
STX4Q12846 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
STX4Q12846 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
STX4Q12846 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
STX4Q12846 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
STX4Q12846 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
STX4Q12846 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
STX4Q12846 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
STX4Q12846 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
STX4Q12846 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
STX4Q12846 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
STX4Q12846 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
STX4Q12846 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STX4Q12846 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STX4Q12846 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STX4Q12846 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STX4Q12846 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STX4Q12846 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STX4Q12846 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STX4Q12846 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STX4Q12846 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STX4Q12846 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
STX4Q12846 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STX4Q12846 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STX4Q12846 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STX4Q12846 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STX4Q12846 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STX4Q12846 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STX4Q12846 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STX4Q12846 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STX4Q12846 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STX4Q12846 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STX4Q12846 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STX4Q12846 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STX4Q12846 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
STX4Q12846 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STX4Q12846 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STX4Q12846 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STX4Q12846 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STX4Q12846 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STX4Q12846 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STX4Q12846 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STX4Q12846 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STX4Q12846 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STX4Q12846 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STX4Q12846 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STX4Q12846 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STX4Q12846 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STX4Q12846 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STX4Q12846 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STX4Q12846 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STX4Q12846 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STX4Q12846 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STX4Q12846 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STX4Q12846 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STX4Q12846 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STX4Q12846 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STX4Q12846 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STX4Q12846 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STX4Q12846 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STX4Q12846 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STX4Q12846 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STX4Q12846 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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