Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms