Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms