Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms