Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms