Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FMODQ06828 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FMODQ06828 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FMODQ06828 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FMODQ06828 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FMODQ06828 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FMODQ06828 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FMODQ06828 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FMODQ06828 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FMODQ06828 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FMODQ06828 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FMODQ06828 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FMODQ06828 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FMODQ06828 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FMODQ06828 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FMODQ06828 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FMODQ06828 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FMODQ06828 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FMODQ06828 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FMODQ06828 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FMODQ06828 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FMODQ06828 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FMODQ06828 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FMODQ06828 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FMODQ06828 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FMODQ06828 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FMODQ06828 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FMODQ06828 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FMODQ06828 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FMODQ06828 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FMODQ06828 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FMODQ06828 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FMODQ06828 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FMODQ06828 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FMODQ06828 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FMODQ06828 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FMODQ06828 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FMODQ06828 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FMODQ06828 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FMODQ06828 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FMODQ06828 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FMODQ06828 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FMODQ06828 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FMODQ06828 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FMODQ06828 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FMODQ06828 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FMODQ06828 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FMODQ06828 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FMODQ06828 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FMODQ06828 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FMODQ06828 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FMODQ06828 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FMODQ06828 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FMODQ06828 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FMODQ06828 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FMODQ06828 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FMODQ06828 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FMODQ06828 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FMODQ06828 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FMODQ06828 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FMODQ06828 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FMODQ06828 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FMODQ06828 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FMODQ06828 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FMODQ06828 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FMODQ06828 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FMODQ06828 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FMODQ06828 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FMODQ06828 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FMODQ06828 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FMODQ06828 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FMODQ06828 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FMODQ06828 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FMODQ06828 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FMODQ06828 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FMODQ06828 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FMODQ06828 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FMODQ06828 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FMODQ06828 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FMODQ06828 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FMODQ06828 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FMODQ06828 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FMODQ06828 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FMODQ06828 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FMODQ06828 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FMODQ06828 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FMODQ06828 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FMODQ06828 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FMODQ06828 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FMODQ06828 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FMODQ06828 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FMODQ06828 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FMODQ06828 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FMODQ06828 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FMODQ06828 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FMODQ06828 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FMODQ06828 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FMODQ06828 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FMODQ06828 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FMODQ06828 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms