Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms