Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms