Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms