Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BEX3Q00994 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms