Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms