Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD1P98174 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD1P98174 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD1P98174 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD1P98174 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD1P98174 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD1P98174 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD1P98174 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD1P98174 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD1P98174 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD1P98174 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD1P98174 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD1P98174 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD1P98174 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD1P98174 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD1P98174 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD1P98174 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD1P98174 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD1P98174 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD1P98174 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD1P98174 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD1P98174 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD1P98174 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD1P98174 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD1P98174 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD1P98174 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD1P98174 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD1P98174 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD1P98174 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD1P98174 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD1P98174 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD1P98174 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD1P98174 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD1P98174 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD1P98174 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD1P98174 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD1P98174 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD1P98174 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD1P98174 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD1P98174 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD1P98174 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD1P98174 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD1P98174 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD1P98174 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD1P98174 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD1P98174 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD1P98174 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD1P98174 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD1P98174 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD1P98174 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD1P98174 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD1P98174 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD1P98174 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD1P98174 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD1P98174 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD1P98174 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD1P98174 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD1P98174 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD1P98174 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD1P98174 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD1P98174 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD1P98174 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD1P98174 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD1P98174 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD1P98174 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD1P98174 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD1P98174 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD1P98174 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD1P98174 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD1P98174 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD1P98174 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD1P98174 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD1P98174 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD1P98174 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD1P98174 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD1P98174 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD1P98174 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD1P98174 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD1P98174 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD1P98174 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD1P98174 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD1P98174 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD1P98174 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD1P98174 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD1P98174 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD1P98174 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD1P98174 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD1P98174 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD1P98174 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD1P98174 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD1P98174 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD1P98174 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD1P98174 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD1P98174 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD1P98174 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD1P98174 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD1P98174 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD1P98174 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD1P98174 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD1P98174 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms