Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRB1P82279 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRB1P82279 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRB1P82279 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRB1P82279 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRB1P82279 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CRB1P82279 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CRB1P82279 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRB1P82279 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CRB1P82279 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRB1P82279 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRB1P82279 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CRB1P82279 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRB1P82279 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRB1P82279 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRB1P82279 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRB1P82279 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRB1P82279 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRB1P82279 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRB1P82279 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRB1P82279 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRB1P82279 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRB1P82279 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRB1P82279 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRB1P82279 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRB1P82279 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRB1P82279 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRB1P82279 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRB1P82279 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CRB1P82279 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRB1P82279 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CRB1P82279 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRB1P82279 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRB1P82279 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRB1P82279 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRB1P82279 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRB1P82279 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRB1P82279 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRB1P82279 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRB1P82279 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRB1P82279 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRB1P82279 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRB1P82279 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRB1P82279 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRB1P82279 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRB1P82279 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRB1P82279 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRB1P82279 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRB1P82279 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRB1P82279 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRB1P82279 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRB1P82279 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRB1P82279 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRB1P82279 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRB1P82279 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRB1P82279 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRB1P82279 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRB1P82279 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRB1P82279 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRB1P82279 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRB1P82279 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRB1P82279 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRB1P82279 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRB1P82279 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRB1P82279 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRB1P82279 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CRB1P82279 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRB1P82279 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRB1P82279 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRB1P82279 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRB1P82279 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRB1P82279 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRB1P82279 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRB1P82279 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRB1P82279 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRB1P82279 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRB1P82279 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRB1P82279 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRB1P82279 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CRB1P82279 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRB1P82279 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRB1P82279 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRB1P82279 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRB1P82279 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRB1P82279 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRB1P82279 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRB1P82279 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRB1P82279 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRB1P82279 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRB1P82279 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRB1P82279 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRB1P82279 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRB1P82279 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRB1P82279 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRB1P82279 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRB1P82279 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRB1P82279 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRB1P82279 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRB1P82279 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRB1P82279 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms