Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms