Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms