Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms