Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms