Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms