Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIPK4P57078 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RIPK4P57078 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RIPK4P57078 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RIPK4P57078 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RIPK4P57078 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPK4P57078 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPK4P57078 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPK4P57078 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPK4P57078 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPK4P57078 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPK4P57078 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPK4P57078 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPK4P57078 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPK4P57078 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPK4P57078 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPK4P57078 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPK4P57078 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPK4P57078 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPK4P57078 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPK4P57078 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPK4P57078 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPK4P57078 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPK4P57078 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPK4P57078 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPK4P57078 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPK4P57078 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPK4P57078 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPK4P57078 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPK4P57078 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPK4P57078 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIPK4P57078 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIPK4P57078 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIPK4P57078 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIPK4P57078 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIPK4P57078 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIPK4P57078 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIPK4P57078 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIPK4P57078 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIPK4P57078 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIPK4P57078 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIPK4P57078 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms