Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AP2S1P53680 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AP2S1P53680 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AP2S1P53680 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP2S1P53680 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AP2S1P53680 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP2S1P53680 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP2S1P53680 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AP2S1P53680 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AP2S1P53680 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP2S1P53680 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP2S1P53680 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP2S1P53680 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP2S1P53680 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP2S1P53680 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP2S1P53680 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AP2S1P53680 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
AP2S1P53680 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP2S1P53680 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP2S1P53680 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AP2S1P53680 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP2S1P53680 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP2S1P53680 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP2S1P53680 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AP2S1P53680 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP2S1P53680 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP2S1P53680 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP2S1P53680 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP2S1P53680 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
AP2S1P53680 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AP2S1P53680 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP2S1P53680 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP2S1P53680 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP2S1P53680 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP2S1P53680 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AP2S1P53680 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AP2S1P53680 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP2S1P53680 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AP2S1P53680 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AP2S1P53680 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AP2S1P53680 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AP2S1P53680 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP2S1P53680 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP2S1P53680 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AP2S1P53680 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AP2S1P53680 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AP2S1P53680 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AP2S1P53680 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
AP2S1P53680 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP2S1P53680 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP2S1P53680 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AP2S1P53680 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AP2S1P53680 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP2S1P53680 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AP2S1P53680 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AP2S1P53680 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP2S1P53680 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AP2S1P53680 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP2S1P53680 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP2S1P53680 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP2S1P53680 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AP2S1P53680 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP2S1P53680 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AP2S1P53680 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP2S1P53680 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP2S1P53680 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP2S1P53680 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP2S1P53680 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AP2S1P53680 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP2S1P53680 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AP2S1P53680 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AP2S1P53680 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP2S1P53680 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP2S1P53680 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AP2S1P53680 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP2S1P53680 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP2S1P53680 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP2S1P53680 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AP2S1P53680 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AP2S1P53680 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AP2S1P53680 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP2S1P53680 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AP2S1P53680 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AP2S1P53680 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AP2S1P53680 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP2S1P53680 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP2S1P53680 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP2S1P53680 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AP2S1P53680 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AP2S1P53680 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP2S1P53680 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
AP2S1P53680 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AP2S1P53680 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AP2S1P53680 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AP2S1P53680 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
AP2S1P53680 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AP2S1P53680 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AP2S1P53680 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AP2S1P53680 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP2S1P53680 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms