Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLK1P49759 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLK1P49759 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLK1P49759 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLK1P49759 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLK1P49759 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLK1P49759 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLK1P49759 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLK1P49759 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLK1P49759 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLK1P49759 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLK1P49759 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLK1P49759 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLK1P49759 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLK1P49759 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLK1P49759 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLK1P49759 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLK1P49759 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLK1P49759 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CLK1P49759 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLK1P49759 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLK1P49759 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLK1P49759 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLK1P49759 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLK1P49759 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLK1P49759 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLK1P49759 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLK1P49759 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CLK1P49759 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLK1P49759 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLK1P49759 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLK1P49759 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLK1P49759 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CLK1P49759 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLK1P49759 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLK1P49759 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLK1P49759 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLK1P49759 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLK1P49759 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLK1P49759 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLK1P49759 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLK1P49759 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLK1P49759 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLK1P49759 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLK1P49759 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLK1P49759 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLK1P49759 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLK1P49759 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLK1P49759 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLK1P49759 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLK1P49759 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLK1P49759 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLK1P49759 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLK1P49759 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLK1P49759 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLK1P49759 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CLK1P49759 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLK1P49759 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLK1P49759 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLK1P49759 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLK1P49759 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLK1P49759 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLK1P49759 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLK1P49759 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLK1P49759 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLK1P49759 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLK1P49759 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CLK1P49759 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLK1P49759 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLK1P49759 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CLK1P49759 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLK1P49759 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLK1P49759 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLK1P49759 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLK1P49759 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLK1P49759 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CLK1P49759 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLK1P49759 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLK1P49759 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLK1P49759 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLK1P49759 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLK1P49759 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLK1P49759 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLK1P49759 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLK1P49759 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLK1P49759 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLK1P49759 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLK1P49759 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLK1P49759 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLK1P49759 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLK1P49759 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLK1P49759 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLK1P49759 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLK1P49759 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CLK1P49759 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLK1P49759 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLK1P49759 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLK1P49759 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLK1P49759 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLK1P49759 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms