Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms