Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
GNPDA1P46926 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms