Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms