Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC1P33527 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms