Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA13P31271 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA13P31271 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA13P31271 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA13P31271 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA13P31271 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA13P31271 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA13P31271 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA13P31271 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA13P31271 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA13P31271 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA13P31271 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms