Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms