Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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