Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4AP27815 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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