Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD27P26842 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD27P26842 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD27P26842 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD27P26842 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD27P26842 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD27P26842 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD27P26842 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD27P26842 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD27P26842 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD27P26842 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD27P26842 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD27P26842 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD27P26842 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD27P26842 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD27P26842 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CD27P26842 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD27P26842 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD27P26842 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD27P26842 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD27P26842 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD27P26842 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD27P26842 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD27P26842 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD27P26842 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CD27P26842 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD27P26842 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD27P26842 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD27P26842 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD27P26842 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD27P26842 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD27P26842 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD27P26842 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD27P26842 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD27P26842 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD27P26842 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD27P26842 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD27P26842 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD27P26842 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD27P26842 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD27P26842 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD27P26842 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD27P26842 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD27P26842 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD27P26842 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD27P26842 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD27P26842 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD27P26842 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD27P26842 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD27P26842 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD27P26842 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD27P26842 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD27P26842 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD27P26842 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD27P26842 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD27P26842 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD27P26842 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD27P26842 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CD27P26842 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CD27P26842 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CD27P26842 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD27P26842 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CD27P26842 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD27P26842 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD27P26842 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD27P26842 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD27P26842 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD27P26842 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD27P26842 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD27P26842 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD27P26842 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD27P26842 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CD27P26842 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD27P26842 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD27P26842 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD27P26842 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD27P26842 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD27P26842 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD27P26842 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD27P26842 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD27P26842 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD27P26842 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CD27P26842 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD27P26842 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD27P26842 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD27P26842 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD27P26842 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD27P26842 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD27P26842 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD27P26842 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CD27P26842 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CD27P26842 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD27P26842 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD27P26842 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD27P26842 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD27P26842 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD27P26842 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD27P26842 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD27P26842 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD27P26842 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms