Protein–RNA interactions for Protein: P25106

ACKR3, Atypical chemokine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR3P25106 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms