Protein–RNA interactions for Protein: P24386

CHM, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP24386 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHMP24386 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHMP24386 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHMP24386 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHMP24386 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHMP24386 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHMP24386 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHMP24386 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHMP24386 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHMP24386 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHMP24386 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHMP24386 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHMP24386 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHMP24386 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHMP24386 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHMP24386 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHMP24386 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHMP24386 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHMP24386 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHMP24386 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHMP24386 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHMP24386 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHMP24386 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHMP24386 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHMP24386 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHMP24386 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHMP24386 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHMP24386 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHMP24386 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHMP24386 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHMP24386 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHMP24386 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHMP24386 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CHMP24386 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHMP24386 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHMP24386 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHMP24386 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHMP24386 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHMP24386 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHMP24386 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHMP24386 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CHMP24386 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHMP24386 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CHMP24386 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHMP24386 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CHMP24386 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CHMP24386 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHMP24386 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHMP24386 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHMP24386 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHMP24386 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHMP24386 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHMP24386 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHMP24386 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHMP24386 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHMP24386 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CHMP24386 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHMP24386 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHMP24386 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHMP24386 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHMP24386 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHMP24386 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHMP24386 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHMP24386 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHMP24386 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHMP24386 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHMP24386 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHMP24386 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHMP24386 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHMP24386 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHMP24386 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHMP24386 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHMP24386 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHMP24386 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHMP24386 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHMP24386 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHMP24386 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHMP24386 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHMP24386 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHMP24386 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHMP24386 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHMP24386 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHMP24386 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHMP24386 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHMP24386 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHMP24386 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHMP24386 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHMP24386 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHMP24386 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHMP24386 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHMP24386 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHMP24386 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHMP24386 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHMP24386 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHMP24386 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHMP24386 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHMP24386 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHMP24386 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHMP24386 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHMP24386 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms