Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
HRCP23327 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HRCP23327 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HRCP23327 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HRCP23327 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HRCP23327 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HRCP23327 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HRCP23327 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HRCP23327 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HRCP23327 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HRCP23327 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HRCP23327 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HRCP23327 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HRCP23327 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HRCP23327 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HRCP23327 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HRCP23327 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HRCP23327 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HRCP23327 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
HRCP23327 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
HRCP23327 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HRCP23327 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HRCP23327 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HRCP23327 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HRCP23327 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HRCP23327 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HRCP23327 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HRCP23327 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HRCP23327 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HRCP23327 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HRCP23327 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HRCP23327 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HRCP23327 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HRCP23327 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HRCP23327 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HRCP23327 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HRCP23327 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HRCP23327 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HRCP23327 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HRCP23327 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HRCP23327 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
HRCP23327 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HRCP23327 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HRCP23327 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HRCP23327 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HRCP23327 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HRCP23327 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HRCP23327 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HRCP23327 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HRCP23327 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HRCP23327 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HRCP23327 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HRCP23327 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HRCP23327 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HRCP23327 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HRCP23327 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HRCP23327 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HRCP23327 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HRCP23327 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HRCP23327 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HRCP23327 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HRCP23327 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HRCP23327 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HRCP23327 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HRCP23327 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
HRCP23327 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HRCP23327 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HRCP23327 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
HRCP23327 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HRCP23327 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HRCP23327 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HRCP23327 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HRCP23327 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HRCP23327 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HRCP23327 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HRCP23327 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HRCP23327 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HRCP23327 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HRCP23327 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HRCP23327 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HRCP23327 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HRCP23327 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HRCP23327 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HRCP23327 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HRCP23327 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HRCP23327 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HRCP23327 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HRCP23327 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HRCP23327 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HRCP23327 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HRCP23327 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HRCP23327 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HRCP23327 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HRCP23327 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HRCP23327 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HRCP23327 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HRCP23327 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HRCP23327 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HRCP23327 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HRCP23327 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms