Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD247P20963 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD247P20963 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD247P20963 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD247P20963 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD247P20963 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD247P20963 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD247P20963 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD247P20963 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD247P20963 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD247P20963 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD247P20963 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD247P20963 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD247P20963 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CD247P20963 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD247P20963 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CD247P20963 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD247P20963 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD247P20963 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD247P20963 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD247P20963 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CD247P20963 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD247P20963 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD247P20963 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD247P20963 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD247P20963 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD247P20963 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD247P20963 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CD247P20963 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD247P20963 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD247P20963 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD247P20963 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD247P20963 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD247P20963 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD247P20963 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD247P20963 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD247P20963 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD247P20963 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD247P20963 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD247P20963 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD247P20963 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD247P20963 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CD247P20963 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD247P20963 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD247P20963 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD247P20963 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD247P20963 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD247P20963 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD247P20963 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD247P20963 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD247P20963 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD247P20963 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD247P20963 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD247P20963 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD247P20963 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD247P20963 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD247P20963 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD247P20963 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD247P20963 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD247P20963 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD247P20963 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD247P20963 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD247P20963 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD247P20963 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD247P20963 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD247P20963 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD247P20963 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD247P20963 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD247P20963 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD247P20963 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD247P20963 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD247P20963 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD247P20963 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD247P20963 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD247P20963 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD247P20963 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms