Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms