Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VCLP18206 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VCLP18206 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VCLP18206 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VCLP18206 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VCLP18206 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VCLP18206 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VCLP18206 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VCLP18206 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VCLP18206 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VCLP18206 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VCLP18206 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VCLP18206 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VCLP18206 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VCLP18206 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VCLP18206 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VCLP18206 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VCLP18206 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VCLP18206 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VCLP18206 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VCLP18206 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VCLP18206 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VCLP18206 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VCLP18206 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VCLP18206 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VCLP18206 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VCLP18206 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VCLP18206 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VCLP18206 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VCLP18206 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VCLP18206 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VCLP18206 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VCLP18206 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VCLP18206 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VCLP18206 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VCLP18206 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VCLP18206 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VCLP18206 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VCLP18206 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VCLP18206 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VCLP18206 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VCLP18206 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VCLP18206 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VCLP18206 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VCLP18206 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VCLP18206 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VCLP18206 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VCLP18206 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VCLP18206 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VCLP18206 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VCLP18206 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VCLP18206 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VCLP18206 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VCLP18206 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VCLP18206 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VCLP18206 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VCLP18206 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VCLP18206 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VCLP18206 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VCLP18206 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VCLP18206 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VCLP18206 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VCLP18206 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VCLP18206 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VCLP18206 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VCLP18206 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VCLP18206 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VCLP18206 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VCLP18206 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VCLP18206 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VCLP18206 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VCLP18206 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VCLP18206 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VCLP18206 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VCLP18206 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VCLP18206 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VCLP18206 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VCLP18206 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VCLP18206 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VCLP18206 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VCLP18206 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VCLP18206 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VCLP18206 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VCLP18206 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VCLP18206 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VCLP18206 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VCLP18206 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VCLP18206 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VCLP18206 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VCLP18206 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
VCLP18206 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VCLP18206 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VCLP18206 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VCLP18206 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VCLP18206 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VCLP18206 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VCLP18206 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VCLP18206 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VCLP18206 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VCLP18206 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms