Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSPP15924 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSPP15924 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DSPP15924 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSPP15924 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSPP15924 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSPP15924 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSPP15924 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSPP15924 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSPP15924 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSPP15924 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSPP15924 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSPP15924 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSPP15924 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSPP15924 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DSPP15924 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSPP15924 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSPP15924 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSPP15924 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DSPP15924 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSPP15924 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSPP15924 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSPP15924 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSPP15924 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSPP15924 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSPP15924 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSPP15924 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSPP15924 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSPP15924 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSPP15924 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSPP15924 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSPP15924 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSPP15924 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSPP15924 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSPP15924 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DSPP15924 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSPP15924 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSPP15924 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSPP15924 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DSPP15924 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSPP15924 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSPP15924 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSPP15924 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSPP15924 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSPP15924 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSPP15924 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSPP15924 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSPP15924 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSPP15924 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSPP15924 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSPP15924 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSPP15924 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSPP15924 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DSPP15924 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSPP15924 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSPP15924 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSPP15924 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSPP15924 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSPP15924 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSPP15924 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSPP15924 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSPP15924 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSPP15924 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSPP15924 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSPP15924 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSPP15924 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSPP15924 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DSPP15924 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSPP15924 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSPP15924 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSPP15924 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSPP15924 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSPP15924 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSPP15924 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSPP15924 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSPP15924 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSPP15924 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DSPP15924 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSPP15924 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSPP15924 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSPP15924 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSPP15924 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSPP15924 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSPP15924 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSPP15924 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSPP15924 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
DSPP15924 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DSPP15924 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DSPP15924 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DSPP15924 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DSPP15924 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSPP15924 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSPP15924 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSPP15924 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSPP15924 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSPP15924 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DSPP15924 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DSPP15924 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSPP15924 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DSPP15924 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms