Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD8BP10966 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD8BP10966 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD8BP10966 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD8BP10966 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD8BP10966 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD8BP10966 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD8BP10966 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD8BP10966 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CD8BP10966 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD8BP10966 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD8BP10966 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD8BP10966 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD8BP10966 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD8BP10966 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD8BP10966 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD8BP10966 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD8BP10966 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD8BP10966 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CD8BP10966 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD8BP10966 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD8BP10966 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD8BP10966 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD8BP10966 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD8BP10966 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD8BP10966 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD8BP10966 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD8BP10966 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD8BP10966 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD8BP10966 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD8BP10966 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD8BP10966 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD8BP10966 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD8BP10966 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD8BP10966 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD8BP10966 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD8BP10966 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD8BP10966 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD8BP10966 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD8BP10966 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD8BP10966 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD8BP10966 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD8BP10966 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD8BP10966 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD8BP10966 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CD8BP10966 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD8BP10966 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD8BP10966 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD8BP10966 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD8BP10966 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD8BP10966 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD8BP10966 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD8BP10966 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD8BP10966 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD8BP10966 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD8BP10966 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD8BP10966 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD8BP10966 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD8BP10966 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD8BP10966 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD8BP10966 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD8BP10966 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD8BP10966 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD8BP10966 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD8BP10966 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD8BP10966 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD8BP10966 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD8BP10966 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD8BP10966 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CD8BP10966 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CD8BP10966 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD8BP10966 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD8BP10966 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CD8BP10966 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CD8BP10966 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD8BP10966 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD8BP10966 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD8BP10966 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD8BP10966 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD8BP10966 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD8BP10966 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD8BP10966 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD8BP10966 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD8BP10966 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD8BP10966 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD8BP10966 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD8BP10966 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD8BP10966 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CD8BP10966 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD8BP10966 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CD8BP10966 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD8BP10966 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD8BP10966 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD8BP10966 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD8BP10966 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD8BP10966 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD8BP10966 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD8BP10966 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD8BP10966 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD8BP10966 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 354.1 ms