Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms