Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYBBP04839 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYBBP04839 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYBBP04839 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYBBP04839 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CYBBP04839 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYBBP04839 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYBBP04839 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYBBP04839 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYBBP04839 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYBBP04839 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYBBP04839 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYBBP04839 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYBBP04839 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CYBBP04839 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYBBP04839 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYBBP04839 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYBBP04839 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYBBP04839 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYBBP04839 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYBBP04839 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYBBP04839 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYBBP04839 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYBBP04839 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYBBP04839 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYBBP04839 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYBBP04839 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYBBP04839 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYBBP04839 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYBBP04839 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYBBP04839 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYBBP04839 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CYBBP04839 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYBBP04839 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYBBP04839 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYBBP04839 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYBBP04839 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYBBP04839 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYBBP04839 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYBBP04839 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYBBP04839 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYBBP04839 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYBBP04839 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYBBP04839 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYBBP04839 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYBBP04839 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYBBP04839 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYBBP04839 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYBBP04839 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYBBP04839 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYBBP04839 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYBBP04839 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYBBP04839 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYBBP04839 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYBBP04839 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYBBP04839 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYBBP04839 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYBBP04839 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYBBP04839 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYBBP04839 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYBBP04839 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYBBP04839 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYBBP04839 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYBBP04839 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYBBP04839 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYBBP04839 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYBBP04839 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYBBP04839 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYBBP04839 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYBBP04839 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYBBP04839 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CYBBP04839 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYBBP04839 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYBBP04839 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYBBP04839 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYBBP04839 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CYBBP04839 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYBBP04839 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYBBP04839 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYBBP04839 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYBBP04839 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYBBP04839 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYBBP04839 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYBBP04839 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYBBP04839 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYBBP04839 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYBBP04839 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYBBP04839 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYBBP04839 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYBBP04839 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYBBP04839 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYBBP04839 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYBBP04839 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYBBP04839 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYBBP04839 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYBBP04839 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYBBP04839 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYBBP04839 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYBBP04839 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYBBP04839 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms